Mineralet har voksaktig glans og vanligvis grålig farge, men det finnes flere fargede typer som brukes som edelstener, blant annet karneol og sarder som er rødlige,kryssopras og plasma som er grønne ogheliotrop(ofte kalt blodstein som er grønn med blodrøde flekker.Agat er en båndet variant av kalsedon, likeledes onyks og sardonyks, som har parallelle bånd (brukes til kaméer).

Jaspis, flint, chert og prasem er beslektet med kalsedon, men er mer urene og har kornet tekstur. Kalsedon-mineraler opptrer særlig i hulrom i sedimentære bergarter og i lavaer.

Mineralet er i Norge blant annet kjent fra kalkstein i området Brevik Porsgrunn